(Esto está relacionado con Metroid zero Mission) Después de volverse la más famosa de todas las cazarrecompensas, teniendo éxito en misiones que otros creían imposibles de realizar, Samus fue llamada por la Federación Galáctica. La División de Reclamo Planetario de la Federación Galáctica había sido enviada para capturar especímenes de la especie Metroid para estudios, pero fueron eliminados por los Piratas Espaciales. La captura de estos especímenes fue un grave problema para la Federación. Los Piratas ya habían probado el potencial de los Metroid en varios planetas controlados por la Federación con increíble éxito. Con cientos de Metroid en su poder, los Piratas Espaciales iniciaron inevitablemente una campaña bélica para conquistar el universo y la civilización galáctica llegaría a su fin.
Después de una larga investigación, la Federación Galáctica logró rastrear a los Piratas y localizar su base en el planeta Zebes. Aunque lanzaron una invasión, la resistencia Pirata fue demasiado fuerte. Después de un largo debate, decidieron enviar a Samus a infiltrarse en la base de los piratas en el planeta y se le dieron dos objetivos:
*Eliminar a todos los organismos Metroid del planeta Zebes.
*Derrotar a la forma de vida mecánica, Cerebro Madre o Mhoter Brain.
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La historia de Samus Aran
RandomMi pasado no es una memoria...es una fuerza en mi espalda. Como en cualquier historia, mi pasado significa propósito. -Samus Aran