León más adelante cumplen varia tareas del asignadas por el gobierno, una de ellas es investigar a Javier hidalgo que manejaba la droga de la región, Javier tenía relación con umbrela y por eso mandaron a león y por precaución se le asignaron un compañero, Jack Krauser, en el camino león y Jack se enteran de muchas cosas, como que Javier tiene una hija llamada manuela, ella estaba enferma y al tratar de ayudarla contacta con umbrela y le dan una muestra del virus verónica para que siga con vida. León le dice que la iba a ayudar a que no se convierta en un mounstro, más adelante león y krauser pelean con Javier que muto gracias a que fue infectado por el virus verónica, león y krauser matan a hidalgo y manuela fue puesta en custodia por el gobierno, más tarde león se entera que su compañero krauser murió en un accidente de helicóptero
En el 2004 salió a la luz el causante de los incidentes en raccoon city que fue el comercio farmausetico umbrela que estaba aciendo experimentos para crear vio armas para conquistar el mundo, luego león es signado de cuidar a la familia presidencial y la hija es capturada así que león se encarga de buscarla, cuando león llega al pueblo los aldeanos de allí no los reciben bien y actuaban de forma extraña, león después descubre que las personas se comportaban así por un grupo que se llamaban los iluminados liderados por osmund saddler los controlaba por medio de un organismo llamado las plagas
El plan de saddler era raptar a la hija del presidente y devolverla con un regalo que era la plaga para que estados unidos se infecte y se peleen entre ellos, durante ese tiempo largo león se encuentra con Luis será que era un científico que trabajaba para saddler pero lo traiciona y ayuda a león, también se encuentra con Ada Wong que estaba por una muestra de las plagas para umbrela, mas adelante se encuentra con krauser que también trabajaba para umbrela y para sadller pero león no lo saben
León encuentra a Ashley y se da cuenta que tanto como ella y el tenían la plaga en su cuerpo. A medida del camino león se ba a enfrentar con varios subordinados de saddler, bitores Méndez, ramos Salazar y Jack krauser león acabo con todos y al final se encuentra con saddler y lo derrota gracias a Ada que le da un lanza misiles rojo y Ada consigue su muestra y le da a león un medio de transporte para que salga de la isla con Ashley y se salvan
