Hilda rêvait depuis sa plus tendre enfance de devenir Dresseuse Pokémon. Un rêve qu'elle partageait en commun avec ses amis d'enfance Tcheren et Bianca. A l'aube de ses 15 ans, Hilda et ses amis sont convoqués dans le laboratoire de Keteleeria, professeure spécialisée dans l'étude des origines des Pokémon et des nouvelles espèces, pour recevoir leur premier compagnon d'aventure. Leur voyage débute jusqu'à Arabelle où le trio rencontre sur la place publique la Team Plasma, une organisation militant pour la libération des Pokémon et le mystérieux N se considérant comme l'ami et le porte parole de ces créatures. Hilda et ses amis ne sont pas au bout de leur peine. L'activité de la Team Plasma inquiète de plus en plus la population et la mystérieuse légende de Reshiram et Zekrom refait surface. L'Idéal et la Réalité sont de nouveaux déchirés. La région d'Unys est menacée et les espoirs pour que la paix subsiste se reposent sur cette jeune Dresseuse de Renouet. Parviendra-t-elle à sauver sa Région et ses amis ? Sera-t-elle l'élue ? "Je veux voir... ce que les autres ne peuvent pas voir. La réalité des Pokémon dans leur Poké Ball... L'image idéalisée du comportement des Dresseurs. Enfin, ce futur parfait pour les Pokémon. Toi aussi, tu désires voir ce monde ?"