Fatmawati meninggal di usia 57 tahun saat berada di Kuala Lumpur.
Saat itu, ia sedang dalam perjalanan pulang setelah melangsungkan ibadah umrah pada 1980. Ia terkena serangan jantung.
Atas jasanya, Fatmawati pun
dinobatkan sebagai Pahlawan Nasional pada 2000 melalui SK Presiden No. 118/TK/2000.