Bir süre sonra Franklin, Haines tarafından Trevor'ı öldürmesi için, Weston tarafından da Michael'ı öldürmesi için zorlanır ve bir çıkmaza sürüklenir. Franklin'in üç seçeneği vardır: Trevor'ı öldürmek, Michael'ı öldürmek ya da ikisinin de yaşamasına izin verip kendi düşmanlarıyla yüzleşmek. Hangi seçeneğin gerçekleştirileceğine oyuncu karar verir. Franklin; Michael'ı veya Trevor'ı öldürdüğü takdirde, arda kalan karakterle ilişkisini keserek eski yaşamına geri döner. Alternatif olarak, eğer hiçbirini öldürmezse, üçlü tüm baskılara karşı göğüs gererek güçlerini birleştirir; Haines'i Stretch'i, Wei'yi ve Weston'ı öldürmek üzere yola koyulur. Tüm düşmanlarını ortadan kaldırdıktan sonra üçlü beraber iş yapmayı bırakırlar, ancak arkadaşlıklarını sürdürürler.
