La primera película de la fase 4 sería un remake de Godzilla vs Biollante, con una difrencia sustancial. Una mayor cantidad de monstruos implicados. La idea principal es que después de la invasión de Destroy All Monsters, Godzilla esté descansando en Monster Island, sin querer implicarse en ningún combate, pero la amenaza de Biollante le obligue a volver a la acción y defender de nuevo a la Tierra ante un nuevo desafío.
Sinopsis: A pesar de haber rechazado una invasión alienígena, las amenazas no paran y ahora, Godzilla y sus alíados deberán afrontar una aberración de la naturaleza, un organismo vegetal conocido como Biollante, que amenaza con asimilar el planeta.
Conexiones y Revelaciones: -Después de la Batalla de Monster Island, un comando científico procedente de la nación ficticia de Kargaristán recogen células de Godzilla donde planea fusionarlas con plantas, para poder recuperar los cúltivos que perdieron durante una de las sequías más destructivas de los últimos año.
-Al mando de este proyecto se encuentran el doctor Selim Nadeer y su hija Fátima. Sin embargo, un grupo terrorista del país destruye el laboratorio del instituto, destruyendo las células y matando a Fátima.
-Cinco semanas después, Selim viaja a Japón y roto por la pérdida de su hija fusionó algunas de las células de Fátima con las de una rosa en un intento por preservar su alma. El científico Kendall Maxwell y el teniente Gary Green de Monarch están utilizando células de Godzilla para crear "bacterias anti-radioactivas", con la esperanza de que pueda servir como un arma de contingencia en caso de que Godzilla se vuelva malvado.
-Intentan reclutar a Selim para ayudarlos, pero son rechazados. Las tensiones internacionales aumentan sobre las células de Godzilla, ya que son codiciadas tanto por el Instituto de Tecnología y Ciencia de Kargaristán como por organizaciones farmacéuticas estadounidenses.
- Un terremoto causa temblores en toda la zona, incluida la casa de Selim, que dañan gravemente las rosas. Selim acepta unirse a Monarhc y se le da acceso a las células de Godzilla, que fusiona en secreto con una de las rosas. Una noche después agentes kargaristanos entran en la casa para hacerse con las células, pero son atacados por la rosa, que ha mutado en una gran planta que escapa hacia el Lago Ashino. La planta mutada es bautizada como Biollante por Selim.
-Desesperados los kargaristanos revelan que hace un tiempo habían capturado a Manda y mandan un ultimatúm a Monarch, de que si no les entregan las células de Godzilla, piensan soltar a Manda en una ciudad de Japón al azar. Kendall y Gary intentan negociar, pero uno de los agentes kargaristanos frustra el intento y escapa con las células. Manda es soltado en Tokio, pero Godzilla llega y lo derrota.
-Mientras tanto, en el Lago Ashino, Biollante se va fortaleciendo. La conciencia de Fátima, traumatizada por su muerte en el ataque terrorista, cree que la humanidad es un cáncer y que debe eliminarla. De esta forma, los alrededores del Lago Ashino se llenan de plantas mutanes derivadas de Biollante que van extendiéndose.
-Godzilla, sintiendo esta nueva amenaza se dirige al Lago Ashino para enfrentarse a Biollante, pero esta derrota a Godzilla. Godzilla se retira a una central nuclear cercana para recuperar energía.
-Godzilla, sabiendo que Biollante es demasiado poderosa, lanza un potente rúgido para llamar a otros titanes. El rúgido es sentido por Mothra en el Templo de la Polilla, que además percibe el alma corrompida de Fátima y todo su odio; y acude a su llamada. Monarch decide hacer uso de Kiryu y Jet Jaguar para ayudar al rey de los monstruos.
-La batalla de Biollante contra Godzilla, Mothra, Kiryu y Jet Jaguar no parece tener fin, ya que aunque esta vez los titanes resisten, Biollante se regenera rápidamente y el alma de Fátima le insta a seguir hasta haber acabado con la humanidad.
-Al final, el teniente Gary tiene la idea de cargar a Jet Jaguar con las "bacterias anti-radioactivas", ya que a fin de cuentas Biollante es según sus palabras como un "clon vegetal de Godzilla", ya que nació de sus células. Al final mientras Biollante se enfrenta a Godzilla, Mothra y Kiryu, Jet Jaguar vuela por encima de Biollante, rociándolo con las bacterias. Biollante acaba siendo disuelta por las bacterias y el alma de Fátima corrompida por su trauma y su odio es purificada por los poderes de Mothra, pudiendo al fín descansar en paz. Al final, los titanes vuelven a sus hogares.
Escena Post-Créditos: -Se revelan que los agentes kargaristanos no trabajan para el instituto de ciencias de Kargaristán sino para una corporación privada. El líder de esta corporación mira la muestra de células de Godzilla y luego mira hacia atrás, donde se ve un mapa de Skull Island. Sonríe y dice:-Ha llegado el momento. Lo que busco se encuentra aquí-.
