El final de Monika comienza después pasar el fin de semana con el cadáver de Yuri, en el cual Natsuki encuentra al jugador / protagonista con el cuerpo de Yuri en la clase, a lo que procede a vomitar y escapar rápidamente del salón. Al ingresar, Monika, reaccionará con indiferencia ante el cuerpo de Yuri y eliminará a todos los demás personajes del juego, excepto a ella misma.
La pantalla se pondrá negra y después mostrará a Monika sentada en una mesa en el aula ahora vacía, con las manos debajo de la barbilla y con un espacio como fondo más allá de las ventanas. Monika le explicará sus motivaciones de sus acciones y confesará haber manipulado el juego para que el jugador se quede solo con ella. Algunas de sus líneas instruyen indirectamente al jugador para que elimine a su personaje al explicar cómo eliminó a todos los demás. Después de su monólogo, Monika dirá que tiene que hacer algo muy rápido y que, mientras tanto, pueden mirarse a los ojos. Monika hablará con el jugador en ciertos intervalos de tiempo sobre asuntos que generalmente conciernen al juego (lista de los temas de Monika). El jugador ahora puede borrar el personaje de Monika accediendo a los archivos del juego (o alternativamente, permitir que Monika continúe hablando durante una eternidad, aunque eventualmente se quedará sin líneas y repetirá las anteriores). Si el jugador decide eliminar a Monika del juego, Monika empezará a fallar, mientras desaparece expresando su enojo hacia el jugador. Luego aceptara que cometió un error y expresará su pesar por lo que le hizo a sus amigos. Acto seguido, Monika revela que no pudo encontrar nada en ella para eliminar por completo a sus amigos, debido a su amor por ellos y por el Club de Literatura. Al llegar a una conclusión, volverá a agregar a todos los personajes al juego excepto a sí misma, quedando como una entidad incorpórea.
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