Finalmente, Samus tras derrotar a Dark Samus y a la Unidad Aurora 313, el Phazon de dentro de su cuerpo desvanecio y se desintegro para siempre junto con los leviatanes y el planeta "Phaze" al completo, destruyendel Phazon, la sustancia que tan en riesgo habia dejado el universo, de la faz de todo este
Sin embargo (el tipico "sin embargo" que se usa para alargar la historia), una extraña nave de los piratas espaciales persigue a Samus tras abandonar "Phaze" la cual estaba siendo controlada por un pequeño bebe de metroide con phazon increiblemente inteligente, que sera el centro de esta historia.
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Metroid Prime 4: Future
Science FictionTras los eventos ocurridos en "Metroid Prime 3: Corruption" Samus se encuentra con una amenaza mas pequeña, pero que con el tiempo, se convertira en algo fuera de su control
