A história se passa 23 dias após Sonic e o Cavaleiro Negro, Eggman volta ataca e Jazz retorna, Eggman enfrenta Sonic, Amy, Tails e Shadow e Zazz enfrenta o Knuckles, Charmy, Vector, Jet e Sonic.
Tails pousa o Tornado no laboratório e ver Amy, Jet, Charmy, Vector e Shadow no seu laboratório, eles todos(a Amy e Jet não) revelem que Eggman voltou a ser vilão, Jet pergunta se sabem onde está Wave e Storm, Amy pergunta como Sonic se feriu e bota a culpa no Tails, Sonic se alevanta
Sonic"tenho que ir rápido... Preciso enfrentar o Eggman"
Vector"um cara roxo também"
Sonic"cara roxo?... Zazz voltou?"
Sonic sai correndo e enfrenta Badniks, Eggman descobre a localização do Sonic e vai até lá, Sonic encontra o Eggman que começa a lançar
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Sonic consegue derrotar o Eggman e corre para Seaside Hill, ele começa a enfrentar Badniks, mas quem aparece é o Zazz
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Zazz começa a lançar estrelas
Zazz"eu esperei muito por isso, Sonic, eu consegui sair daquele local para minha vingança"
Sonic"você saiu atoa, pois será derrotado de novo, pode até ser mais vergonhoso"
Sonic derrota o Jazz, Jazz foge para deixar a vez para o Eggman, Sonic chega em Beach, Tails e os outros acompanham a jornada do Sonic pelo laboratório e Shadow sai do laboratório, Sonic acaba encontrando o Eggman numa parte da areia
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Eggman"isso é um absurdo"
Sonic"você ter me traído, é, isso é um absurdo, Eggman"
Eggman solta Caixas Explosivas, Sonic consegue derrotar o Eggman que vai para longe rondando, Sonic entra em Snow Mountain
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Zazz decide atacar o Sonic enquanto Eggman está tonto de tanto rodar, Zazz é derrotado novamente e Sonic entra em Green Hill
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Tails"cuidado, Sonic"
Sonic"relaxa, foi aqui onde eu e o Eggman tivemos a nossa primeira luta"
Eggman"para trazer nostalgia, vamos relutar"
Sonic luta contra o Eggman e Eggman é derrotado e Sonic vai para os ares em Temple, Sonic começa a correr, Zazz decide atacar, Sonica destrói um Motobug, após isso, Zazz aparece
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Sonic começa a enfrentar o Zazz, Zazz é derrotado e Sonic cai em Sky Sanctuary, Sonic tenta atacar o Jazz, mas não consegue e começa a quebra Badniks, mas Tails ver o Eggman indo para trás e Sonic não percebe, Tails tenta avisar, mas o microfone cai e Tails não consegue avisar, Eggman aparece por trás lançando mísseis
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Sonic desvia dos mísseis e derrota o Eggman, mas Eggman joga o Sonic para Mushroom Hill e Sonic quebra a Eggmobile
Sonic"Mushroom Hill de novo não"
Sonic começa a correr por Mushroom Hill
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Zazz ver que a Eggmobile do Eggman está quebrada e para fazer vingança, Zazz decide ir para acabar de vez com o Sonic, Sonic acaba encontrando o Zazz, Zazz, Sonic destrói o Moon Mech e Zazz é derrotado, Zazz revela ser um zeti, Sonic volta para o Laboratório do Tails e garante que eles passaram uns dias de paz.
