Los monstruos han escapado del subsuelo, pero el entorno de Frisk, decide mudarse a una ciudad francesa para que Frisk pudiese estudiar en un instituto llamado Kadic.
Cuando llega, los guerreros de Lyoko creen haber derrotado a XANA, pero lo que no...
El día ya había llegado, era el día en que los guerreros de lyoko iban a destrozar la replika especial de Core-U. Jeremy un domingo, reunio a todo el equipo en la fabrica para hacer la misión "Con está segunda replika destruida, estaremos más cerca de destruír a XANA, y está vez de manera definitiva" dijo Jeremy mientras virtualizaba a Aelita, Odd y Yumi en el sector 5, cuando los virtualizo William y Ulrich fueron los siguientes en virtualizarse también en el sector 5, entonces los cinco fueron rápidamente al hangar del Skid.
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Una vez que los guerreros de lyoko fuerón teletransportado adentro del Skid, Jeremy entonces libero los anclajes y Aelita concujo el Skid hacía un tunel que daba hacía el sector de las montañas, luego Aelita sumergio el Skid al mar digital, entonces el Skid salio de lyoko, entonces Jeremy le dio a Aelita, entonces Aelita condujo el Skid hasta un agujero de gusano, entonces Aelita metio el Skid en el agujero de gusano y este fue transportado a una zona cercana a Core-U, rápidamente Aelita condujo el Skid hacía Core-U, entonces el Skid entro en Core-U, listo para destruír otra replika especial de XANA.
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Una vez que el Skid entro en Core-U, Aelita fue a buscar una torre para anclarla, entonces cuando Aelita encontro una torre, Aelita anclo el Skid a la torre "Bien Aelita, ahora voy a activar la torre" dijo Jeremy mientras empezaba a activar la torre "Bien, ¿quienes quieren destruír la torre?" pregunto Jeremy a los tripulantes del Skid "Yo..." dijeron a la vez Ulrich y Yumi, entonces Jeremy empezo a materalizar a Yumi y Ulrich "Materalizar Ulrich, materalizar Yumi" dijo Jeremy cuando materalizo a Yumi y Ulrich en la zona donde estaba el superordenador de Core-U.
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Yumi y Ulrich aparecieron dentro... del monte ebott "¿Jeremy, donde estamos?" pregunto Ulrich a Jeremy "Eso lo averiguare en unos segundos" dijo Jeremy antes de mandar a localizar el lugar, pero cuando Jeremy lo hizo, se sorprendio del lugar "¡No puede ser!" dijo Jeremy "¿Qué pasa Jeremy?" pregunto Yumi a Jeremy "¡Estaís dentro del monte ebott!" dijo Jeremy "¿¡QUÉ!?" dijeron sorprendidos a la vez Ulrich y Yumi "¿Y ahora que hacemos?" pregunto Ulrich "Teneís que ir al nucleo del subsuelo y destruirlo" dijo Jeremy, entonces Jeremy empezo a indicar a Ulrich y Yumi donde tenían que ir.
Mientras tanto en Core-U, William, Aelita y Odd estaban protegiendo el Skid y la torre de posibles ataques de XANA "¿Y donde están Ulrich y Yumi?" pregunto Odd "En el Monte Ebott" respondio Jeremy, cosa que sorprendio mucho no solo a Odd, si no también a William y Aelita, pero en ese momento Jeremy detecto una torre activada en Core-U "Bueno, vuestro aburrimiento se a acabado" dijo Jeremy antes de enviar el overwing y el overbike.
En cuantoa Yumi y Ulrich, ellos estaban en el laboratorio de Hotland "Yumi, Ulrich, XANA a activado una torre en Core-U, ¿Notaís algo raro?" pregunto Jeremy a Yumi y Ulrich "Todavía no" respondio Yumi, pero en ese momento ella y Ulrich escucharon un ruido detrás de ellos, cuando Ulrich y Yumi se giraron vieron a dos monstruos... XANIFICADOS.
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Eran dos ex-guardias reales que se quedaron en el subsuelo, pero fueron xanificados por ello "¿Y estos quienes son?" pregunto Ulrich asustado "Son los ex-guardias reales del Rey de los Monstruos" respondio Yumi, entonces Yumi y Ulrich salieron corriendo, corrienron tanto hasta que llegarón al hotel del subsuelo, allí Yumi y Ulrich se cansarón de escapar, "Si escapamos no destruiremos está replika especial" dijo Ulrich mientras sacaba sus dos espadas, mientras que Yumi sacaba sus dos abanicos "XANA, no venceras ni a los monstruos ni a los humanos" dijo Ulrich antes de que el y Yumi empezaran a atacar. Pero en Core-U, William, Odd y Aelita habían llegado a la torre activada, pero estaba protegida por dos megatanques y un bloque.
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Entonces William salto del overwing de Aelita y fue corriendo hacía el bloque, destruyendolo en el medio "Sí..." dijo William antes de ser desvirtualizado por uno de los megatanques "No volvere a confiarme nunca más" dijo William al salir del escáner, en ese momento Odd disparo una flecha láser a uno de los megatanques, destruyendolo y antes que el otro pudiera reaccionar, Aelita lo destruyo con uno de sus bolas de energía "Princesa, ya puedes desactivar la torre" dijo Odd a Aelita antes de que esta entrase en la torre activada y la desactivase.
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La torre fue desactivada con exito por Aelita, mientras Yumi y Ulrich vieron como los ex-guardias reales fueron des-xanificados antes de desmayarse "Bueno Yumi, hora de destruir el núcleo" dijo Ulrich a Yumi antes de que se dirigieran a la base del núcleo, en el núcleo, Yumi y Ulrich les toco superar trampas de lásers llegaron a un puente que daba a la zona final del núcleo "¿Jeremy, donde está el superordenador para destruirlo?" pregunto Ulrich "Dejame verlo" dijo Jeremy antes de inspeccionar el mapa del núcleo "Ya está, simplemente Ulrich tienes que clavarle una espada a una pared, pero antes la cargare con un virus que destruira todo" dijo Jeremy antes de programar el virus en la espada de Ulrich, una vez que la espada estubo cargada con el virus, Ulrich clavo la espada en una pared, después de un minuto, el núcleo empezo a destruirse, entonces Jeremy mando a Yumi y Ulrich al Skid de nuevo "Bien, ya estamos todos ¡vamonos!" dijo Aelita antes de desanclar el Skid e irse de Core-U mientras desaparecia "Otra misión cumplida, ahora solo nos queda una replika especial" dijo Jeremy mientras veia en el ordenador las coordenadas de la tercera y ultima replika especial que les quedaba por destruír.
