Pada 16 September, Barcelona kedua kalinya mengumumkan pembaruan kontrak terhadap Messi; kali ini bayarannya dinaikkan sebagai bagian dari anggota tim utama dan akan berakhir pada Juni 2014. [21] Messi mendapat kewarganegaraan Spanyol pada 26 September 2005[35] dan akhirnya dapat tampil di La Liga . Ia pertama kali tampil di Liga Champions UEFA pada 27 September saat melawan klub Italia, Udinese Calcio . [30] Para suporter Barcelona di
Camp Nou memberikan penghormatan setelah ia dicadangkan, karena gaya permainannya yang memikat. [36]
Messi mencetak enam gol dari 17 penampilan di liga, dan satu gol di
Liga Champions. Kariee di musim itu berakhir pada 7 Maret 2006, setelah cedera yang ia alami di perempatfinal leg kedua Liga Champions melawan
Chelsea . [37] Pasukan Rijkaard mengakhiri musim sebagai juara Spanyol dan Eropa.
