Plusieurs années ont passé après Yu-Gi-Oh Duel Monsters. La KaibaCorp a créé la Duel Academy, destinée à former des duelistes d'excellence. Kisaragi Morenaga, souhaite intégrer cette académie afin de réaliser son rêve pour surpasser Yugi Muto. Mais...
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Un peu plus tard dans la nuit, Kisaragi essayait de trouver le sommeil, en vain. Les nuages dans le ciel avaient la même couleur que celle du Sceau d'Orichalque et cela l'inquétait. Cela voudrait dire qu'il n'avait plus assez de temps pour battre Dartz. D'ailleurs, il ne savait même pas si Seto Kaiba avait gagné son duel...
C'est sur cette pensée qu'il prend la décision de se mettre à la recherche de Dartz. Il va dans sa salle de bain pour enfiler la veste des Bleu Obelisk, puis il sort sa chambre. Il fut surpris de trouver Nova, qui était sur le point de toquer à sa porte.
- " Shadow ? Que fais-tu ici ?" demande Kisaragi, même si au fond il connaissait la réponse
- " Je suis venu te chercher pour retrouver Dartz. Les couleurs dans le ciel ne me disent rien qui vaille. Et puis.. je m'inquiète pour monsieur Kaiba."
- " Tiens donc, sous tes attitudes de bad boy se cache en réalité un homme de cœur~" le ton de Kisaragi était moqueur
- " Hmph. Pas de temps à perdre, allons y."
Kisaragi et Nova sortent du dortoir des bleus et partent en direction de la forêt. Pour couvrir plus de terrain, ils décident de se séparer. Du côté de Nova, il n'a trouvé aucune piste de Dartz. En revanche, il est tombé sur quelqu'un qu'il n'aurait jamais aimé croiser. Et pour cause, cette personne était Riders...
- " Toi.." commence Nova
- " Nova Shadow. Tant de choses se sont passées depuis notre première rencontre. Malheureusement, ce n'est pas ce soir que nous allons régler nos comptes."
- " Parce que tu penses que c'est toi qui décides du moment où j'ai envie de te faire la peau ?"
- " Évidemment ! Ce soir, mon objectif est juste de te retenir. Donc faisons un duel classique, juste pour que tu constates le fossé qui nous sépare."
- " Un duel hein ? Soit. {Morenaga, je compte sur toi pour trouver Dartz..} Je vais t'écraser et te prouver que tu n'es pas aussi infaillible que tu le penses."
- " C'est ce que nous allons voir !"
- " DUEL !!!" dirent-ils en chœur
Du côté de Kisaragi, ce dernier attérit dans une petite clairière. En arrivant, la première personne qu'il remarque est un homme assez grand de taille, avec des cheveux bruns et les yeux bleus. Cet homme était au sol, sans doute inconscient. Puis, à une quinzaine de mètres de Kisaragi, se trouve un autre homme aux yeux varions et aux cheveux émeraudes. Kisaragi le reconnaît immédiatement, tout comme il reconnaît l'homme qui est inconscient....
