Después de desesmarcarár los secretos de NERV y SEELE, Gendo toma cartas en el asusto y usa al JSSDF para aniquilar a todos los empleados y pilotos de NERV y recuperar a los civiles para esconder sus verdaderas intenciones. Por otro lado, NERV se defenderá como pueda e intentara sobrevivir en esta guerra o muerte en el que solo el más fuerte saldrá victorioso y acabaran de una vez por todas con los planes de SEELE y Gendo para evitar el plan de instrumentalización humana y el posible tercer impacto. Shinji por primera vez en su vida dejara de esconderse y peleará por el futuro que siempre soñó y acabar con el sufrimiento de todos. ¿Quién ganará en esta guerra de superioridad? Los derechos de la mayoría de personajes no son míos, sino de su respectivo creador Hideaki Anno.
8 parts