Tsukasa è un giovane che si ritrova in un dungeon all'interno di The World. Sembra piuttosto smarrito e appena incontra Mimiru, una giovane giocatrice, fugge via. In seguito i due si incontrano nuovamente e a questo punto Mimiru viene a sapere che il ragazzo non è in grado di eseguire il log out, ovvero di uscire dal gioco e ritornare alla propria vita. Catalogato inizialmente come un evento impossibile dalla ragazza e da Bear, un altro giocatore, la notizia di questo strano giocatore arriva alle orecchie di Subaru e del gruppo dei Cavalieri Scarlatti, che controllano le attività degli utenti nel gioco. In breve tempo si forma un gruppo di giocatori intenti a sbrogliare la matassa di misteri che circondano questa disfunzione del programma. In particolare, dalle investigazioni di Bear, si scopre che Tsukasa in realtà nel mondo esterno è una ragazzina che in passato ha subito maltrattamenti e che giace in coma in un ospedale.
Nel frattempo Tsukasa viene accolto in una zona segreta del videogioco, in cui la sua sola compagna è una bambina di nome Aura, immobile e fluttuante sopra un letto. Di tanto in tanto un'entità invisibile di nome Morgana, che sembra l'artefice del bug che affligge The World, si mette in contatto con lui e gli chiede di rimanergli fedele. Qui incontra anche un buffo personaggio felino, Maha, che sembra volergli fare da supporto morale. Ma Tsukasa è combattuto, non sa decidere se vuole rimanere intrappolato per sempre nella Rete, nella sua nuova casa, o tornare alla propria vita. Ma quando Morgana sente di non aver più nessun potere su di lui, decide di annientarlo
