Pensando que estaba sola en el mundo, Skyler huye a la guerra para servir a su país y llevarle la contraria a su hermano mayor. Es aquí donde conoce a Erik Lensherr, un niño que le demuestra que hay más personas especiales allí afuera y años más tarde se une a él en busca del asesino de su madre, Sebastián Shaw. Juntos se encuentran con el profesor de genética, Charles Xavier y juntan un equipo de personas con poderes especiales para evitar la inminente guerra nuclear que quiere desatar Shaw para desaparecer a la humanidad, o hacerla mutar para así darle ventaja a la siguiente especie evolutiva que está naciendo en el planeta.