Data opublikowania: 16:06 06-08-2020
Ostatnia aktualizacja: 16:06 06-08-2020
Wczoraj zapisałam sobie pewien link na FB. Zajrzałam tam dzisiaj i pochłonęło mnie całkowicie.
1) Julich-Brain (Atlas) jest to nazwa pierwszego atlasu 3D ludzkiego mózgu. Zawiera ok. 250 strukturalnych obszarów (korowych i jąder podkorowych), każdy z nich był bazowany na analizie dziesięciu mógów. Ich łączna długość to prawie dwa tysiące metrów. Atlas pomaga łączyć dane dotyczące ekspresji genów, łączności i aktywności funkcjonalnej (connectivity and functional activity). Ciągle dodawane są nowe skany, więc nie jest to statyczny atlas mózgu.
Jest to część EBRAINS, projektu European Human Brain Project. Dla niego Komisja Europejska zatwierdziła 150 miliardów euro do 2023 roku. - źródło 1
Temu projektowi poświęcono masę czasu, bo ponad ćwierć wieku. Pomimo tego, obrazy są tam jako mapy prawdopodobieństwa. Różnice są dopuszczalne, bowiem każdy mózg jest inny. Mapy można wykorzystać do symulacji lub zastosować sztuczną inteligencję aby badała podział pracy między obszarami mózgu. Ogromne ilości generowanych w ten sposób danych są przetwarzane za pomocą platformy obliczeniowej EBRAINS. Moc obliczeniową dostraczaja europejska sieć superkomputerów FENIX.
Jak się to wszystko zaczęło? Wpierw nabyto 23 skany MRI martwych mózgów, pokrojono je na cienkie plastry niczym woda czy jakoś tak (wafer-thin sections) a następnie je zdigitalizowano.
[Digitalizacja, dygitalizacja, cyfryzacja, ucyfrowienie – nadawanie postaci cyfrowej danym pisanym i drukowanym, zawartym na nośnikach magnetycznych lub innych. Definicja z SJP.]
Poprawili zniekształcenia (ang. distortions), które wynikły z pocięcia na plastry przy użcyiu danych ze skanów MRI. Ustawili ustawili neurony w kolejnych sekcjach aby zrekonstruować cały mózg.
Badanie było gotowe do opublikowania 27 lutego, a 24 czerwca przyjęto do publikacji. Zostało opublikowane 30 lipca 2020.
Możemy zobaczyć, ile osób i z jakiego kraju je wspomniało. Sprawdźcie sobie źródło 5.
Autorzy: prof. Katrin Amunts, Hartmut Mohlberg, Sebastian Bludau, Karl Zilles. (Wyczytałam, że byli to badacze niemieccy).
Nawet mamy adres e-maila w razie chęci nawiązania kontaktu. Ekstra, nie?
Napisałabym może coś wiecej, ale kiedy chcę wejśc w jakiekolwiek DOI, wyświetla, że nie ma takowego. Trudno.
DOI - Cyfrowy Identyfikator Obiektu. Zajmuje się tym międzynarodowa organizacja non-profit. Z tego, co wiem, każde badanie ma swoój adres DOI.
Atlas macie dostępny tutaj:
https://jubrain.fz-juelich.de/apps/cytoviewer2/cytoviewer-main.php#
Możecie też wpisać w wyszukiwarkę JuBrain Cytoarchitectonic Atlas Viewer.
Ciężko mi się obsługuje, jedyne, co mi wychodzi, to obracanie. Jakimś cudem włączyłam to i owo, ale biegła w tym nie jestem, może kiedyś.
Btw. gdybyście kiedyś szukali jakiś informacji, zawsze możecie poszukać poniżej. Jest to strona EBRAINS, wchodzicie w zakładkę Find Data i jesteście na miejscu.
https://kg.ebrains.eu/search/?facet_type[0]=Dataset
Źródła:
1) https://www.technologynetworks.com/neuroscience/news/a-google-earth-for-the-brain-has-been-published-338132?fbclid=IwAR0lIp4sMnL_6zONcrT4WbnjptpdvMOT6MBjRiuhOI9ogSve4eOavJBQpaU
2) https://medicalxpress.com/news/2020-07-centerpiece-d-human-brain-atlas.html
3) https://science.sciencemag.org/content/early/2020/07/29/science.abb4588
4) https://www.doi.org/
5) https://www.altmetric.com/details/86834066
6) https://singularityhub.com/2020/08/05/these-scientists-just-completed-a-3d-google-earth-for-the-brain/
I filmik na koniec
A Three-Dimensional Atlas of the Brain|z kanału Forschungszentrum Jülich
https://www.youtube.com/watch?v=q-Sr8rV9P04
CZYTASZ
🧠 Mózg to nie umysł! 🧠
RandomOkładkę zrobiła @EwaMatuszczak. Miejsce na notatki ze studiów z cyklu nie wiem, ale się dowiem. Chciałabym swoimi działaniami zainspirować innych do podążania za marzeniami oraz rozwijaniem zainteresowań. Wierzę, że podane tutaj informacje zostaną...
